德国欧洲分子生物学实验室(EMBL)访问学者、博士后招聘（环境微生物组数据计算分析）

职位描述：

我们正在寻找一个非常积极的计算生物学家加入分子系统生物学单元的Peer Bork研究小组作为访问学者、博士后研究员。该生物信息学小组致力于广泛的主题，目前的重点是不同生态系统中的微生物组分析。我们的团队由具有不同背景的研究人员组成，包括生物信息学、宏基因组序列分析和海洋生态学。如果您正在通过环境建模、土壤生态学、生物地球化学、生态生理学、系统生物学或相关方法研究微生物组，请申请！

在TREC(穿越欧洲海岸线)项目中，我们收集了3000多个土壤、沉积物和水样本，目前正在分析由此产生的微生物组和多组学数据。在EU-资助的BIOcean5D项目中收集了额外的数据，我们在该项目中分析全球生物多样性模式，并努力整合公共宏基因组数据(如SPIRE数据库)和相应的上下文数据。

工作职责：

您将分析从TREC探险中收集的数据，并将其与来自土壤、沉积物和海洋的现有大规模微生物数据集(例如，宏基因组、元转录组、代谢组)整合。有不同的项目领域，例如

(1)分析TREC样本以回答进化、功能和生态问题，如环境和人类对生物多样性模式的影响，

(2)整合多组学数据以进行功能解释，

(3)量化全球不同生境之间的基因和分子功能通量。

这项工作旨在进行生物学发现，将包括方法和应用两个方面。一个独特的方面是非常大的微生物组数据数据集的可用性，这使得探索新的机器学习和人工智能方法的使用变得可行。此外，我们正在利用其他数据来源，如全球气候和海洋生物地球化学数据库或卫星数据。

申请要求：

生物学、生物信息学、计算机科学或相关领域的博士学位

分析大规模环境数据集的成熟生物背景知识和生物信息学技能

在以下领域(或相关主题)具有专长:环境建模、土壤生态学、生物地球化学、生态生理学、系统生物学

具有数据整合、统计分析和可视化的经验，例如Python或R

独立工作和团队合作的能力

愿意根据项目要求学习新技能

良好的沟通、人际交往和英语能力

你也可能有

熟悉处理下一代测序数据和执行序列分析

了解环境背景下的微生物生态学

微生物学或收集环境样本方面的实验专长

具有使用Linux命令行和计算集群的经验

要了解更多信息，请访问-EMBL-研究员-职业-服务